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如何理解生物合成基因簇,这个概念局限于微生物范围,还是包括 …
生物合成基因簇(Biosynthetic gene clusters,BGCs),也是属于看起来高级,实际就是字面意思的名词。字面意思是一同编码某个生物合成途径的一簇基因。 字面意思是一同编码某个生物合成途径的一簇基因。
如何oku? - 知乎
对于基因家族,按照传统的概念,认为是在染色体上距离接近,功能类似的基因簇(cluster)。但实际上,我们生物信息学对于基因家族的概念一般有两种分类:(1)按功能划分。例如我们常用的CAZyme注释或者Pfam注释,会把一些功能类似的基因聚类,形成一个家族。
基因簇(gene cluster)与基因家族(gene family)有何区别?
基因簇是指基因家族中来源相同、结构相似和功能相关的基因在染色体上彼此紧邻所构成的串联重复单位。一个基因簇中的基因往往是编码催化同一新陈代谢途径的不同步骤的酶的结构基因。 区别应该是基因簇是紧密相邻的一组相关基因,而基因家族是可以紧密 ...
如何准确理解基因家族、基因簇、scaffold、motif?_百度知道
2024年11月15日 · 基因簇是指在基因组中距离较近、功能相关的基因集合。它与基因家族概念紧密相关,通常由基因家族成员构成。 scaffold与contig是二代基因组测序结果组装过程中的关键概念。原始测序数据读取(reads)通过组装形成初步长序列即contig。
簇是什么意思? - 百度知道
2024年7月12日 · 一个文件可能占用多个簇,这些簇连续存储,提高了存储效率。 此外,在生物信息学中,簇也常用于基因序列的分析。 通过聚类算法,将相似的基因序列聚集在一起,形成基因簇,有助于研究人员进行基因功能的研究和疾病基因的挖掘。
antiSMASH数据库:微生物次生代谢物合成基因组簇查询和预测
2024年7月15日 · antiSMASH数据库能为研究者提供一个使用方便、注释了的生物合成基因簇最新集合,可以让研究者在提供复杂的问题之后轻松地进行基因组之间的分析。 作者在文章中提供了antiSMASH的相关网站信息,并在实例中以链霉菌中核糖体合成并进行转录后翻译且不是 ...
dbCAN-PUL:多糖利用位点预测(PULs) - 百度知道
2024年9月26日 · dbCAN-PUL专注于包含实验验证的原核CAZyme基因簇,这些簇能作用于碳水化合物底物,即多糖利用位点或PULs。 dbCAN-PUL提供在线预测服务,用户只需上传基因组核苷酸序列即可。用户可以通过首页的Blastx功能开始预测过程。
基因簇的名词解释 - 百度知道
基因组重组是指染色体上的dna片段交换、倒位和转座等事件,这些事件可能导致基因簇的形成或破坏。 4、基因簇的功能基因簇在生物体内具有重要的生物学意义,例如在细胞分化、器官发育和免疫反应中发挥重要作用。在细胞分化中,基因簇可以控制特定细胞 ...
Gene cluster (基因簇)和基因簇家族有什么区别 ... - 知乎
什么是基因簇家族(Gene Cluster Families)?Gene cluster (基因簇)和基因簇家族有什么区别?
基因簇名词解释 - 百度知道
基因簇少则可以是由重复产生的两个相邻相关基因所组成,多则可以是几百个相同基因串联排列而成。 他们属于同一个祖先的基因扩增产物。 也有一些基因家族的成员在染色体上排列并不紧密,中间还含有一些无关序列。